علاوه بر این، باکری عملیات تروریستی علیه کشور اسرائیل را از طریق اقداماتی که در خاک اسرائیل، سوریه و لبنان انجام می‌شد، گنجاند و پیش برد. یگان تحت فرماندهی او عملیات آسیب رساندن به نیروهای ارتش اسرائیل را که در منطقه حائل در سوریه فعالیت می‌کردند، با استفاده از عوامل سوری که پیشتر در ارتش اسد خدمت کرده بودند، پیش برد. باکری و معاون او، محمد رضا انصاری، شخصاً این فعالیت را رهبری کردند. علاوه بر این، باکری شروع به هدایت تلاش‌ها برای قاچاق سلاح نظامی از ایران به خاک اسرائیل کرد. حذف او به ضربه عمیقی که ارتش اسرائیل به یگان عملیات ویژه نیروی قدس وارد کرد، می‌پیوندد و ضربه دیگری به توانایی‌های این یگان برای انجام عملیات تروریستی علیه کشور اسرائیل و شهروندان آن وارد می‌کند.